Existen multitud de discusiones acerca del problema que tiene MySQL cuando transcurre mucho tiempo sin procesar consultas que consiste en necesitar una reconexión (lo cual provoca una excepción ‘recuperable’ en nuestra aplicación). Aunque la solución general consiste en configurar una serie de propiedades en la conexión con MySQL, existe un método infalible: definir la fuente de datos directamente en Tomcat y consumirla en Grails a través de JNDI.

Más información sobre Use JNDI datasource for MySQL in Grails and Tomcat 6.0 (traducido al español).